《表3 怒江红山茶转录组微卫星序列的各重复次数及数量》

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《基于高通量测序的怒江红山茶微卫星位点特征分析》

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怒江红山茶转录组序列中各重复类型的重复次数差异较大（图2），其中主要的微卫星序列为二核苷酸重复（59.50%），其次为三核苷酸重复（20.70%）和单核苷酸重复（13.48%），四、五、六核苷酸重复序列较少，仅占6.32%（图3，表3）。其重复次数波动于4～23次，总体表现为重复次数随重复单元中核苷酸数量的增加而减少，其中单核苷酸重复12～23次，二核苷酸重复6～12次，三核苷酸重复5～10次，其余核苷酸重复4～6次，不同核苷酸重复类型主导的重复次数也不相同。SSR的出现频率随重复次数的增加而降低；与此同时，随着SSR重复类型碱基数的增加，重复次数减少。当重复次数大于12次后，SSR出现的频率明显下降，只有单核苷酸类型还有SSR出现，其他核苷酸类型已经没有SSR的出现（图2，表3）。总体来看，SSR的重复次数以4～10次最多，占85.50%，11～15次的占9.06%，重复次数在15次以上的不足5.5%（图4），表现为随着重复次数的增加，SSR数量呈降低的趋势。