《表2 凡纳滨对虾转录组微卫星分析结果》

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《凡纳滨对虾微卫星分子标记的开发及不同养殖家系遗传多态性分析》

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凡纳滨对虾转录组SMRT测序共获得51367条非冗余全长转录本序列（GenBank登录号SRX3267788～SRX3267801），利用MISA对这些转录本序列进行分析，共获得39674条微卫星序列，分布在29461条转录本序列中，包含微卫星的序列占总序列的57.35%。序列拼接总长度为171322994 bp，微卫星的分布密度为0.232 SSR/kb，平均每4.32 kb出现1条微卫星序列。各核苷酸重复类型的凡纳滨对虾微卫星数量差异明显，其分布密度也存在明显差异。在所鉴定的39674条凡纳滨对虾微卫星序列（表2）中，二核苷酸重复微卫星序列分布最多，共有22223条（占56.01%）；三核苷酸重复微卫星序列14781条（占37.26%），四核苷酸重复微卫星序列1947条（占4.91%），六核苷酸重复微卫星序列441条（占1.11%）；分布最少的是五核苷酸重复微卫星序列，仅有282条（占0.71%）。