《表2 云南栘(木衣)转录组SSR各重复基元及其比例》

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《基于高通量转录组测序的云南栘(木衣)微卫星位点特征分析》


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32 360个SSR位点共包含150种重复基元,单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸、六核苷酸重复分别有2种、4种、10种、20种、10种、24种。在单核苷酸中,A/T重复基元占比较大(33.01%),C/G重复基元较少(1.69%);二核苷酸中各重复基元所占比例差异较大,各基元所占比例依次为:AG/CT(39.76%)>AT/TA(3.71%)>AC/GT(3.20%)>CG/CG(0.09%);三核苷酸重复类型中AAG/CTT基元所占比例较多,为4.52%;AGG/CCT基元、ACC/GGT基元、AGC/CTG基元和ATC/ATG基元,所占比例分别为3.51%、2.33%、2.28%和1.20%;而AAC/GTT基元、AAT/ATT基元、ACG/CGT基元、ACT/AGT基元、CCG/CGG基元所占比例较低,均小于1%(表2)。