《表4 款冬SSR重复基元的类型》

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《款冬转录组SSR标记开发及其多态性研究》


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款冬转录组SSR位点共包含60种重复基元,单核苷酸至六核苷酸重复基元分别有2、4、10、20、11和13种。从出现频率来看,单核苷酸A/T(1 473个)基元出现频率最高,占总SSR的31.42%,其次为二核苷酸基元AG/CT(600个)和三核苷酸基元ATC/ATG(451个),分别占12.80%、9.62%。单核苷酸重复基元中以A/T最多,占单核苷酸重复总数的97.10%;二核苷酸重复基元中出现最多的是AG/CT,占二核苷酸重复总数的45.39%,其次是AC/GT、AT/AT,分别占29.95%、24.58%;CG/CG出现最少,仅有1个。在三核苷酸重复基元中,ATC/ATG(451)重复基元最多,占总三核苷酸重复基元的25.92%,其次是AAG/CTT、ACC/GGT,分别为18.97%、17.64%。其他四、五、六核苷酸重复基元类型较多,但每种类型数量较少,为1~3个,出现频率较低(表4)。