《表4 款冬SSR重复基元的类型》
款冬转录组SSR位点共包含60种重复基元,单核苷酸至六核苷酸重复基元分别有2、4、10、20、11和13种。从出现频率来看,单核苷酸A/T(1 473个)基元出现频率最高,占总SSR的31.42%,其次为二核苷酸基元AG/CT(600个)和三核苷酸基元ATC/ATG(451个),分别占12.80%、9.62%。单核苷酸重复基元中以A/T最多,占单核苷酸重复总数的97.10%;二核苷酸重复基元中出现最多的是AG/CT,占二核苷酸重复总数的45.39%,其次是AC/GT、AT/AT,分别占29.95%、24.58%;CG/CG出现最少,仅有1个。在三核苷酸重复基元中,ATC/ATG(451)重复基元最多,占总三核苷酸重复基元的25.92%,其次是AAG/CTT、ACC/GGT,分别为18.97%、17.64%。其他四、五、六核苷酸重复基元类型较多,但每种类型数量较少,为1~3个,出现频率较低(表4)。
图表编号 | XD00113692000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.28 |
作者 | 贺润丽、韩毅丽、段静静、刘计权、王莉花 |
绘制单位 | 山西中医药大学中药学院、山西中医药大学中药学院、山西中医药大学中药学院、山西中医药大学中药学院、云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室 |
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