《表5 不同重复基元类型的SSR分布频率》

《表5 不同重复基元类型的SSR分布频率》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于草莓全基因组SSR标记的开发和应用》


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二倍体和八倍体草莓的单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸SSR基序类型数量完全一样(表5),分别是2,4,10和32种;五核苷酸类型比八倍体少一种基序类型,六核苷酸类型少24种类型。A/T在二倍体和八倍体草莓的SSR中出现的频率最高,分别占SSR的39.45%和37.08%。虽然G+C在二倍体和八倍体草莓中占38.35%和24.07%,但SSR重复基序G/C占比仅为1.47%和1.86%。在二核苷酸类型中,二倍体草莓的AT/AT占比最高,为11.61%,其次为AG/CT (占8.74%);八倍体草莓的与二倍体相反,AG/CT占比最高,占9.94%,其次为AT/AT (占比为7.35%)。其它重复类型的SSR出现的频率相对较低,二倍体草莓中AACGC/CGTTG、ACGCG/CGCTG、ACGGC/CCGTG、CCCCG/CGGGG、CCGCG/CGCGG等五核苷酸类型仅鉴定到1个SSR位点,CCCCCG/CGGGGG等29种六核苷酸类型鉴定到1个SSR位点;八倍体草莓中五核苷酸类型ACGCG/CGCTG仅鉴定到1个SSR位点,CCCGGG/CCCGGG等13种六核苷酸重复类型鉴定到1个SSR位点。