《表2 二,三碱基主要重复基元类型及频率分布》

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《基于RNA-seq牡丹SSR标记开发及通用性分析》

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215个位点包含112种重复基元，二核苷酸至六核苷酸重复分别有5、34、6、1和66种；在二核苷酸重复中，最常见的基元是TC/GA （30.00%），其次是AT/TA （27.50%）和AG/CT （27.50%），共占总SSR重复的15.35%。三核苷酸基元中以CCA/TGG （8.89%）、GAA/TTC （8.89%）、TCT/AGA （7.78%）、AAG/CTT（6.67%）和GAG/CTC （6.67%）最多，共占总SSR重复的16.28%。在四、五、六核苷酸里面没有明显的占主导地位的基元（表2）。本研究EST-SSR片段长度分布范围为8～24 bp，其中二核苷酸重复基元长度均为8 bp，三核苷酸重复基元长度范围为9～12 bp，四核苷酸重复基元长度范围为12～16 bp，五核苷酸重复基元均为15 bp，六核苷酸重复基元长度范围为12～24 bp。统计发现本研究EST-SSR片段长度大小与重复序列的长短呈正相关。