《表1 文冠果SSR标记的类型, 数量及分布频率》

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《高通量RNA-seq技术开发文冠果目的基因SSR标记》

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依据文冠果根、叶、花和果实高通量转录组的45 335条Unigenes，利用MISA方法在其中的11 756条Unigenes中发现了12 606个SSR标记，SSR发生频率是25.93%（发现SSR位点的Unigenes数占总Unigenes数的百分比）。对于11 756条发现SSR位点的Unigenes，每条至少含有1个SSR位点，其中的850条发现了两个或两个以上的SSR位点，平均每4 066 bp中发现了1个SSR位点。所发现的SSR标记中，34.29%的为单核苷酸重复，32.82%的为二核苷酸重复，29.22%的为三核苷酸重复，0.69%的为四核苷酸重复，1.59%的为五核苷酸重复，1.39%的为六核苷酸重复（表1；图1）。