《表3 刺五加SSR的类型, 数量及分布》

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《RNA-seq技术开发刺五加目的基因SSR标记》

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利用MISA软件从刺五加转录组的86 315条Unigene中搜索到12096个SSR位点，分布在10333条Unigenes上，其发生频率为11.97%（有SSR位点分布的Unigenes占总Unigenes的比值），每条最低含有1个SSR位点，1 475条含有2个以上的SSR位点（表2），平均每4 496 bp中分布有1个SSR位点。在刺五加转录组中的SSR重复类型中，单核苷酸重复最多，占40.37%，其次为二核苷酸（35.79%）和三核苷酸（21.11%）（表3） 。A/T类型是数量最多的单核苷酸重复单元；在二核苷酸重复类型中，AG/CT类型最多（2 173）；三核苷酸重复类型中，AAG/CTT类型出现次数最多（607）（图1） 。