《表1 温带臭虫中开发的SSR数量及分布》

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《基于转录组测序的温带臭虫SSR和SNP位点分析》

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温带臭虫转录组序列经过msatcommander v0.8.2软件的分析后，共得到了4 758个SSR，占总转录组序列的18.68%，即出现频率。这4 758个SSR分布于4 171条序列中，占总序列的16.38%，即发生频率。所发现的SSR长度在12～45个碱基之间变化。从温带臭虫转录组中发掘出的6种核苷酸重复中，单核苷酸重复次数最多，占总SSR数量的58.74%，其次是三核苷酸重复，其数量少于单核苷酸重复，占总SSR个数的20.68%。六核苷酸重复的次数最少，只有2个，仅占总数的0.04%，并且每种核苷酸重复在重复次数上存在一定的差异（表1）。例如，单核苷酸重复一般出现12～14次，二核苷酸重复则较多地出现，为6～7次，三核苷酸重复的重复次数主要为5～6次，而四、五、六核苷酸重复次数主要为4次。