《表1 垂穗披碱草中开发的14个SSR位点信息》
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《基于简化基因组测序开发垂穗披碱草(Elymus nutans)SSR标记》
注:Ta:退火温度;NA:等位基因数Note:Ta:Annealing temperature;NA:Number of alleles
我们从139对引物中挑选出90对引物进行了多态性筛选和验证。扩增电泳结果显示,在这90对引物中有36对扩增条带无多态性,18对扩增非特异性条带较多,15对在部分材料中未扩增出目的带,7对扩增效果不好。剔除以上,最终确定了90对中14对(15.6%)具有多态性的SSR引物(表1)。在这14个SSR位点中,二碱基和三碱基重复基序各为5个,分别占待筛选二碱基重复基序位点数13.9%和13.5%;四碱基重复基序4个,占待筛选四碱基重复基序位点数100%。14对引物PCR扩增产物片段大小在105~182 bp间;观察到的等位基因数为2~5,平均每个位点的等位基因数为2.9(表1)。
图表编号 | XD0019078600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.03.28 |
作者 | 刘瑞娟、路兴旺、窦全文 |
绘制单位 | 中国科学院西北高原生物研究所中国科学院高原生物适应与进化重点实验室、中国科学院大学、中国科学院西北高原生物研究所中国科学院高原生物适应与进化重点实验室、中国科学院大学、中国科学院西北高原生物研究所中国科学院高原生物适应与进化重点实验室、中国科学院西北高原生物研究所青海省作物分子育种重点实验室 |
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