《表1 垂穗披碱草中开发的14个SSR位点信息》

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《基于简化基因组测序开发垂穗披碱草(Elymus nutans)SSR标记》


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注:Ta:退火温度;NA:等位基因数Note:Ta:Annealing temperature;NA:Number of alleles

我们从139对引物中挑选出90对引物进行了多态性筛选和验证。扩增电泳结果显示,在这90对引物中有36对扩增条带无多态性,18对扩增非特异性条带较多,15对在部分材料中未扩增出目的带,7对扩增效果不好。剔除以上,最终确定了90对中14对(15.6%)具有多态性的SSR引物(表1)。在这14个SSR位点中,二碱基和三碱基重复基序各为5个,分别占待筛选二碱基重复基序位点数13.9%和13.5%;四碱基重复基序4个,占待筛选四碱基重复基序位点数100%。14对引物PCR扩增产物片段大小在105~182 bp间;观察到的等位基因数为2~5,平均每个位点的等位基因数为2.9(表1)。