《表3 菜头肾叶绿体基因组中SSR位点类型及数量》

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《基于高通量测序的菜头肾叶绿体基因组的组装及序列分析》

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在菜头肾叶绿体全基因组中，共搜索184个符合条件的SSR位点（表3），多分布于LSC区，其中包括92个单核苷酸重复基元，10个二核苷酸重复基元，67个三核苷酸重复基元，9个四核苷酸重复基元，4个五核苷酸重复基元和2个六核苷酸重复基元。在所有SSR中，最多重复基元是A/T，然后依次是AT/TA、TTG/TTA和ATA/ATA。由此可以看出，A/T基元占优势，具有碱基偏好性。这与菜头肾叶绿体全基因组富含AT（含量为61.65%）一致，这种偏好性可能是由于AT比GC更容易解链有关。