《表1 菜头肾叶绿体基因组碱基组成》

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《基于高通量测序的菜头肾叶绿体基因组的组装及序列分析》

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基于高通量测序，发现菜头肾全基因组总长为144 713 bp，碱基为5 196 698 700 bp，具一个典型的4分区域结构，包含4个区段：LSC为92 026 bp、SSC为17 825 bp、2段反向互补重复的IR区（IRA和IRB)17 431 bp。GC含量为38.35%，有效数据Q20值、Q30值分别96.58%和90.91%。IR、LSC和SSC区域的GC值存在一定的差异，IR区域的GC值最高，为45.47%；LSC次之，36.49%；SSC区域的GC值最小，仅32.34%（表1）。值得注意的是，部分ycfl基因在SSC和IRB交界处重复（图l）。