《表1 3种竹子叶绿体编码基因的总碱基组成》

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《竹亚科叶绿体基因组的密码子使用偏性分析》

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3种竹子在整个编码区的碱基组成十分相似（表1），CAI值均为0.167。比较同义密码子3个位置的碱基组成发现，GC含量并非均匀分布:第1位的碱基含量最高，约50%；第2位的含量GC2与GCall、GCcds含量较一致；第3个位置GC3最低，仅为28%左右。统计得出，2个木本竹的有效密码子数接近，ENC值分别在38.02~61和39.41~61之间，草本竹O.latifolia则表现出较大的偏性（34.22~59.18）。除O.latifolia中rps18基因的ENC值小于35外，大部分基因的ENC值接近61，说明叶绿体基因的密码子使用偏性较弱。各氨基酸同义密码子的使用频数分析结果如表2所示，3个竹种对29个密码子的使用具有共同的偏好（RSCU>1），其中以T或A结尾的密码子居多，分别为16个和11个，说明竹亚科植物偏爱结尾为T的密码子。此外，2个密码子的使用偏性在物种间有差异:相比其它2种竹子，A.fargessii对UCA的使用度大于1；O.latifolia在编码脯氨酸时较少使用密码子CCC。