《表1 三叶崖爬藤叶绿体基因组碱基组成》

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《三叶崖爬藤叶绿体基因组的组装与序列分析》

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利用Illumina HiSeq X Ten测序，去除接头和低质量的数据后，共得到14 536 090条长度约为150 bp的序列。利用NOVOPlasty进行组装，经注释后得到三叶崖爬藤的叶绿体基因组。结果表明，三叶崖爬藤的叶绿体基因组的测序深度达537×，基因组大小为160 189 bp，GC值37.5%（表1），具一个典型的4分区域结构，包括1个LSC、1对IR和1个SSC，它们的长度分别为88 185、26 519、18 966 bp（图1）。IR、LSC和SSC区域的GC值存在一定的差异，IR区域的GC值最高，为42.9%，LSC次之，为35.5%，SSC区域的GC值最小，仅31.7%（表1）。利用PCR克隆了4个边界的序列，经测序后与组装结果进行比对，发现序列完全一致。