《表1 两种梧桐叶绿体基因组密码子第3位碱基组成及GC含量(单位:%)》

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《两种梧桐叶绿体基因组密码子使用偏性分析》

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通过CodonW和在线CUSP对美丽梧桐、云南梧桐叶绿体编码基因组的52条CDS进行分析，结果如表1所示，美丽梧桐、云南梧桐叶绿体编码基因密码子CT3和CA3的含量分别为46.56%、46.67%与43.04%、43.17%，表明两种梧桐叶绿体编码基因第3位碱基以A/T结尾为主。密码子上不同位置碱基GC含量有所差异，第1位碱基的GC含量最高，分别为46.10%、46.17%；其次为第2位，分别为38.14%、38.06%；最低为第3位碱基，分别为30.11%、29.92%，且两种梧桐叶绿体基因组GC含量分别为38.12%、38.05%，表明叶绿体编码基因富含A/T碱基。ENC值可反映密码子偏性程度，其取值范围为20～61，ENC值越小表明偏性越强，ENC值越大则密码子偏性越弱，一般以ENC的值为35时区分密码子偏性强弱（Jiang et al.，2008）。本研究中，两种梧桐叶绿体基因组的ENC值为50左右，大于35表明其密码子偏性较弱。