《表2 两种梧桐叶绿体编码基因密码子GC含量(单位:%)》

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《两种梧桐叶绿体基因组密码子使用偏性分析》


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利用在线CUSP对各基因密码子不同位置碱基的GC含量进行分析,结果如表2所示,不同基因的GC含量存在一定的差异,CGC1、CGC2与CCG3差异较大,两种梧桐叶绿体编码基因ENC范围分别为36.91~56.46、36.55~58.04,且大部分基因的ENC大于44,表明叶绿体编码基因密码子偏性较弱。美丽梧桐、云南梧桐中atpE基因的ENC值最大,分别为56.46和58.04,说明美丽梧桐中编码atpE基因密码子偏性强于云南梧桐,同时两种梧桐叶绿体编码基因GC含量、ENC值之间也存在差异,但差异不大。此外,本研究还发现,美丽梧桐中不存在clpP基因及云南梧桐中的ndhK基因为假基因,表明两种梧桐叶绿体基因组具有较高的保守性,但种间却存在一定的差异。