《表1 秋茄叶绿体基因组不同位置的GC含量》

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《秋茄叶绿体基因组密码子使用偏好性分析》

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对筛选到的50条秋茄叶绿体蛋白质编码序列进行分析，结果如表1所示。密码子第1、2和3位上的GC平均含量分别为46.23%、38.68%和27.62%，GCall平均含量为37.51%，说明密码子不同位置上的GC含量不同，其中又以GC3含量最低，即偏好使用以A/U结尾的密码子。Nec范围在35.40～55.50之间，平均值为47.02。以Nec<45说明密码子使用偏好性强，Nec>45说明密码子使用偏好性弱的标准来判断[16]，其中Nec大于45的基因有35个（表1）。可以看出，秋茄叶绿体基因密码子使用偏好非随机选择，偏好性较弱。