《表4 秋茄叶绿体基因组最优密码子确定》

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《秋茄叶绿体基因组密码子使用偏好性分析》

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注:*表示0.08≤ΔURSC<0.30，**表示0.30≤ΔURSC<0.50，***表示ΔURSC≥0.50。Note:*means 0.08≤ΔURSC<0.30，**means 0.30≤ΔURSC<0.50，***meansΔURSC≥0.50.

根据Nec值大小，分别取最大的5条和最小的5条序列建立高低偏性库，并计算两库的ΔURSC值，其中ΔURSC值>0.3的密码子有UUU、CUC、CUG、GUC、GUG、UCA、ACC、ACA、GCA、UAU、UGC、CGA、AGA、GGC、GGA等共15个（表4），其中AGA密码子ΔURSC值最大，为0.66。以A/U结尾的密码子有8个，以G/C结尾的密码子7个。结合URSC在高低偏性库中的值进行分析，最终得出3个最优密码子，分别是:ACC、ACA和GCA。其中Thr密码子2个（ACC和ACA），Ala密码子1个（GCA）。