《表3 樟树叶绿体基因组最优密码子分析Optimal codons analysis in the chloroplast genome of Cinnumomum camphora》

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《樟树叶绿体基因组密码子偏好性分析》

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注:*表示ΔRSCU>0.08，**表示ΔRSCU>0.3，***表示ΔRSCU>0.5。Note:*meansΔRSCU>0.08，**meansΔRSCU>0.3，***meansΔRSCU>0.5.

对53个候选基因的ENC值进行排序后，先从两端各选取10%的基因建立高、低表达基因库；然后计算两个表达库中密码子的RSCU值和两个库中的ΔRSCU值（表3）；最后确定了26个密码子为樟树叶绿体基因组高表达密码子。对26个密码子的第3位碱基进行分析，其中，以U结尾的有5个，以A结尾的有5个，以C、G结尾的分别为6个和10个。结合26个高表达密码子和图1的32个高频密码子，选取两者的公共部分，最后确定了9个樟树叶绿体基因组最优密码子，分别为UUU、CUU、UCA、ACA、UAU、AAU、GAU、UGA、GGA。其中，所有密码子均以U或A结尾。