《表1 乳油木叶绿体基因组密码子3个位置的GC含量》

《表1 乳油木叶绿体基因组密码子3个位置的GC含量》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《乳油木叶绿体基因组密码子偏好性分析》


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注:GCall:整个蛋白编码区GC含量

利用在线程序CUSP分析乳油木叶绿体中各CDS密码子的GC含量(表1),整个CDS的GC含量为37.77%,GC1为46.55%,GC2为39.35%,GC3为27.47%,说明乳油木叶绿体基因密码子偏好以A和U作为结尾。ENC值一般从完全偏倚的20到无偏倚的61,乳油木的ENC范围在36.31~56.88之间,平均值为42.98,大部分在45以上。说明乳油木的密码子偏性较弱。RSCU分析表明(表3),RSCU值大于1的密码子有28个,其中11个以A结尾、16个以U结尾、1个以G结尾;说明乳油木叶绿体基因偏好以A/U为结尾,不偏好以G/C为结尾。