《表1 乳油木叶绿体基因组密码子3个位置的GC含量》
注:GCall:整个蛋白编码区GC含量
利用在线程序CUSP分析乳油木叶绿体中各CDS密码子的GC含量(表1),整个CDS的GC含量为37.77%,GC1为46.55%,GC2为39.35%,GC3为27.47%,说明乳油木叶绿体基因密码子偏好以A和U作为结尾。ENC值一般从完全偏倚的20到无偏倚的61,乳油木的ENC范围在36.31~56.88之间,平均值为42.98,大部分在45以上。说明乳油木的密码子偏性较弱。RSCU分析表明(表3),RSCU值大于1的密码子有28个,其中11个以A结尾、16个以U结尾、1个以G结尾;说明乳油木叶绿体基因偏好以A/U为结尾,不偏好以G/C为结尾。
图表编号 | XD00146680300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.14 |
作者 | 原晓龙、李云琴、张劲峰、王毅 |
绘制单位 | 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室、云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室、云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室、云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室 |
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