《表1 巨桉叶绿体基因组密码子主要参数》
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为了更加准确分析密码子偏好性，本研究选取了巨桉叶绿体基因组中以AUG为起始密码子且编码区序列长度超过300 nt的43个非重复基因的编码序列为研究对象，采用CodonW软件对参试基因开展密码子相关参数的计算和分析。由表1可知，不同基因密码子不同位置的GC含量并不相同，第1位、第2位、第3位密码子的GC含量的变化范围分别为34.20%～58.90%、27.90%～58.70%、20.20%～37.00%，其平均值分别为47.40%、39.47%、27.97%，且第1位、第2位的GC含量明显高于第3位；ENC的范围在39.49～61.00之间，平均值为47.04；CAI的范围为0.082～0.301，平均值为0.171 4；CBI的范围为-0.222～0.196，平均值为-0.092；FOP的范围为0.263～0.532，平均值为0.356；蛋白质的Gravy变化范围为-0.704～1.102，平均值为0.017。
| 图表编号 | XD00118106200 严禁用于非法目的 |
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| 绘制时间 | 2019.12.01 |
| 作者 | 王鹏良、吴双成、杨利平、王华宇、陈乃明、张照远 |
| 绘制单位 | 广西优良用材林资源培育重点实验室广西壮族自治区林业科学研究院、广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室北部湾大学、广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室北部湾大学、钦州市植物生物技术重点实验室广西钦州市林业科学研究所、广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室北部湾大学、钦州市植物生物技术重点实验室广西钦州市林业科学研究所、广西优良用材林资源培育重点实验室广西壮族自治区林业科学研究院 |
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