《表1 金莲花叶绿体各基因密码子组成和使用参数》

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《金莲花叶绿体基因组密码子偏好性分析》

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注：U3s、C3s、A3s、G3s、GC3s分别代表密码子在第3位上U、C、A、G、GC的百分含量；GC代表基因编码区总GC百分含量；ENC代表有效密码子数。表2同。

用Codon W软件对金莲花叶绿体编码蛋白序列分析，结果显示（表1），基因编码区GC含量在30.70%～46.60%内波动，平均值为38.73%；同义密码子第3位碱基出现U和A频率的平均值较大，分别为45.61%和42.01%；第3位碱基出现G和C频率的平均值较小，分别为17.50%和18.11%；第3位密码子的GC含量（GC3s）平均值为27.60%。这些碱基组成偏好性表明，金莲花叶绿体蛋白编码序列密码子中AU的使用频率高于GC，密码子第3位上的偏好性表明，大部分密码子以A/U结尾。