《表3 影响密码子使用的各因素相关分析》

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《竹亚科叶绿体基因组的密码子使用偏性分析》

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注:*表示显著相关，P<0.05，**表示极显著相关，P<0.01。Note:*indicates significant difference，P<0.05，**indicates highly significant difference，P<0.01.

3种竹子基于各基因的RSCU值进行的对应分析结果中，第1个主要因子轴占总变异量的比值分别为9.68%、10.35%和10.52%（图4），前4个主要因子总贡献量合计为34.31%、34.64%和34.61%。第一轴变异度所占贡献量最大，其余各因子轴的贡献量依次递减，表明3种竹子叶绿体基因的密码子偏性使用模式的形成过程复杂，受到了多种因素的共同作用。将轴1~4与CAI、ENC和GC3进行简单相关（表3），发现3种竹子的第2轴对应值与CAI呈显著负相关关系（P<0.05）；轴4与GC3、ENC呈极显著相关（P<0.01）。此外，CAI和GC3也检测到显著的正相关（P<0.05）。这些结果说明基因的表达水平（选择）是密码子偏性形成的主要因素。图4中由各基因落在第1、2因子轴组成的平面位置，可显示各基因密码子使用性的变异趋势:大部分基因集聚在0点附近，表示这些基因偏性较低且有相似的密码子使用性。一些与基因表达相关的基因、光合作用代谢相关基因和编码NADH脱氢酶亚基的基因分散度较高，这些基因在3种竹子中受到的影响程度不同而分散程度不同，说明尽管3种竹子有着整体相似的密码子使用模式，但不同种间的基因仍有各自特殊的密码子使用演化特征。