《表2 罗氏沼虾表达基因的同义密码子相对使用频率分析及最优密码子分析》

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《罗氏沼虾转录组密码子使用偏好性分析》


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注:带“*”的数值表明对于某一特定的密码子,该密码子较其他密码子使用更频繁(RSCU>1)。

本文针对16 086个密码子(来自筛选得到的6 629条表达基因),深入地分析了同义密码子相对使用频率(RFSC),发现对于各类密码子而言,它们具有明显不同的RFSC值(表2)。此处利用了高频密码子的相关筛选技术。经过分析,确定高频密码子为GAU、GAA、UUU、AAU、CCA,同义密码子2个大于0.6、3个大于0.5、4个大于37.5、6个大于25。