《表3 高,低表达密码子的同义密码子的使用频率》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《桃基因密码子使用模式及其偏好性分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

注:*:最优密码子；加下划线的密码子为高表达优越密码子

表中列出了全部基因的RSCU值（表2），RSCU>1的高频密码子共有27个，分别为TTT，TTG，CTT，ATT，GTT，GTG，TCT，TCA，CCT，CCA，ACT，ACA，GCT，GCA，TAT，CAT，CAA，AAT，AAG，GAT，GAA，TGT，TGA，AGA，AGG，GGT，GGA。其中23个以A/T结尾，4个以G/C结尾。其中偏好性最强的密码子为AGA，其RSCU值为1.85。本研究根据ENC值划分的高表达库与低表达库的RSCU值（表3），以二者差值RSCU>0.08为标准，共鉴定出CTA，CTG，ATA，GTA，TCA，TCG，ACA，ACG，GCA，GAA，TGA，CG-T，CGA，CGG，AGT，AGC等16个高表达优越密码子，其中11个以A/T结尾，5个以G/C结尾。依据高频密码子与高表达优越密码子结果确定4个最优密码子，分别为TCA，ACA，GCA，GAA，它们均以A结尾。