《表3 云南省4个口岸黄胸鼠Cytb基因片段密码子的使用频率》
注:括号内为氨基酸缩写形式;*表示终止密码子;F.表示苯丙氨酸;L.表示亮氨酸;I.表示异亮氨酸;M.表示蛋氨酸;V.缬氨酸;S.表示丝氨酸;P.表示脯氨酸;T.表示苏氨酸;A.表示丙氨酸;Y.表示酪氨酸;H.表示组氨酸;Q.表示谷氨酰胺;N.表示天冬酰胺;K.表示赖氨酸;D.表示天冬
通过MEGA v7.0软件分析,统计4个不同口岸地区黄胸鼠的密码子使用频率,从而推断Cytb编码区的密码子使用频率和氨基酸组成。从表3、4可知,密码子UCA、CUA和CCA的使用频率较高,分别为3.19%、3.11%和3.09%。也有一些氨基酸并未出现,包括AUG、GUG、CCG、ACG、GCG等。氨基酸的组成显示,亮氨酸、异亮氨酸和苯丙氨酸使用频率较高,分别为15.13%、10.44%和8.17%。
图表编号 | XD00180597400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.20 |
作者 | 刘莹莹、曹晓梅、慈颖、杨燕、卢云兰、张晓龙、方志强 |
绘制单位 | 中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所、中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所、中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所、中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所、云南国际旅行卫生保健中心、中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所、中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所 |
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