《表4 陆地棉扩展蛋白基因密码子的相对使用频率》

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《陆地棉扩展蛋白基因的鉴定与特征分析》

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aa：氨基酸Amino acid；Cod：密码子Codon；Freq：频率Frequency

密码子的偏好性分析既可以为基因表达选择适合的表达系统，又能为密码子的改造而改变基因表达量提供依据。生物的遗传密码中，除色氨酸和甲硫氨酸只有一个密码子外，其余氨基酸都有一个以上的简并密码子。简并密码子中，某一密码子相对同义密码子使用频率单值超过60%或者超过该组同义密码子平均占有频率的1.5倍的密码子即为高频密码子。对陆地棉72个扩展蛋白基因家族成员的18 455个密码子进行统计分析（表4），数据显示，UUG、CCU、GCU、AGA、AGG为高频密码子；UCG、CCG、ACG、GCG、CGG等第2、3位碱基为C和G的密码子为稀有密码子。4个亚家族之间的比较发现，AGG是4个亚家族共有的高频密码子，CGG是共有的低频密码子；EXPA和EXLA 2个亚家族具有较多相似的偏好性密码子。