《表4 俄罗斯红参线粒体全基因组编码蛋白基因密码子使用情况》

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《引入养殖俄罗斯红参线粒体全序列结构与分析》


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注:加粗为偏好密码子

13个编码蛋白基因全长为10868 bp,占全序列的67.5%,共编码3186个氨基酸(除终止密码子外)。氨基酸编码频率最高为丝氨酸Ser(S),其次为亮氨酸Leu(L)。使用Mega软件统计密码子使用情况(表4),13个编码蛋白基因的密码子完整,且存在30个偏好密码子,其中第3位点对A或T(U)的使用频率较高。除ND1以GTG为起始密码子,其他均以ATN为起始密码子。ND2、ND4L、COX2,ATP8、COX3、ND3、ND5和Cytb起始密码子为ATG,COX1、ATP6和ND6以ATT为起始密码子,而ND4以ATA为起始密码子。终止密码子都是完整密码子,除ND2与ND4的终止密码子分别为TTG与TAG外,其他终止密码子以TAA为主。