《表4 大豆线粒体编码基因的相对同义密码子使用度》

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《栽培大豆和野生大豆线粒体基因组密码子使用偏性的比较分析》

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注:*表示ΔRSCU≥0.08且RSCU值≥1。

对栽培大豆和一年生野生大豆线粒体基因组各编码序列的Nc值进行排序，分别从两极各选出8个基因构建高、低表达组。按组计算各基因同义密码子的RSCU值，并根据对高表达密码子和高频率密码子的定义，最终确定了栽培大豆和野生大豆TTT、TTA、CTT、ATT、GTA、TCC、CCT、ACT、ACA、GCT、CAA、AAT、AAA、GAT、GAA、CGT、AGA、GGT18个共有的最优密码子。此外，确定了CAT和CGA为栽培大豆的最优密码子；GTT、TGT和GGA为野生大豆的最优密码子。以上最优密码子中以A结尾有9个，以T结尾的有13个，以C结尾的有1个，没有以G结尾的最优密码子。暗示了大豆线粒体基因组偏好于使用A或T结尾的密码子（表4）。