《表2 红松CHS基因同义密码子相对使用度》

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《红松查尔酮合成酶基因CHS密码子偏好性分析》

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注:下划线表示红松CHS基因该密码子使用频率较高

对红松CHS基因使用频率和RSCU值统计发现（详见表2），61个密码子中使用频率最大的是AAG和GAG（45.34%），26个密码子RSCU值大于1，是红松CHS基因的偏好密码子。GCC、TTC、GGA、ATC、CCC、AGA、AGT、CTC、CTG、TAC共10个密码子的RSCU值大于1.5，表明是该基因的高频率密码子，其中GGA（2.06）、CCC（2.48）、AGA（2.47）、CTG（2.31）这4个密码子的RACU值均大于2，表明该基因对这些密码子具有极强的偏好性。我们发现，编码Leu的CTA的RSCU值为0，说明该密码子可能不参与红松CHS基因的翻译过程。此外，红松中NTA型密码子（GTA:0.38，ATA:0.33，TTA:0.15，CTA:0）的RSCU值较低，这可能有利于m RNA的降解以提高蛋白含量，NCG型的密码子RSCU值（CCG:0.19，GCG:0.48，TCG:1.43，ACG:0.50）较低，表明红松可能是一种甲基化程度较高的植物。