《表4 大豆线粒体编码基因的相对同义密码子使用度》
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《栽培大豆和野生大豆线粒体基因组密码子使用偏性的比较分析》
注:*表示ΔRSCU≥0.08且RSCU值≥1。
对栽培大豆和一年生野生大豆线粒体基因组各编码序列的Nc值进行排序,分别从两极各选出8个基因构建高、低表达组。按组计算各基因同义密码子的RSCU值,并根据对高表达密码子和高频率密码子的定义,最终确定了栽培大豆和野生大豆TTT、TTA、CTT、ATT、GTA、TCC、CCT、ACT、ACA、GCT、CAA、AAT、AAA、GAT、GAA、CGT、AGA、GGT18个共有的最优密码子。此外,确定了CAT和CGA为栽培大豆的最优密码子;GTT、TGT和GGA为野生大豆的最优密码子。以上最优密码子中以A结尾有9个,以T结尾的有13个,以C结尾的有1个,没有以G结尾的最优密码子。暗示了大豆线粒体基因组偏好于使用A或T结尾的密码子(表4)。
图表编号 | XD00147720800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.07.01 |
作者 | 唐向民、杨守臻、陈怀珠、孙祖东、赖振光、曾维英、韦清源 |
绘制单位 | 广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所、广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所、广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所、广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所、广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所、广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所、广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所 |
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