《表3 CaERF109和CaABR1的同义密码子相对使用度》

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《橄榄CaERF109和CaABR1基因的克隆及其表达特性分析》

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下划线表示在CaERF109和CaABR1中该密码子使用频率较高；RSCU:相对使用度The underlines mean codon usage with high frequency in CaERF109 and CaABR1；RSCU:Relative synonymous codon usage

密码子偏好性分析结果显示，CaERF109和CaABR1有效密码子数ENc分别为54.54和51.35，表明二者密码子偏好性较弱。在密码子组成上，CaERF109的GC和GC3s值分别为0.530和0.535，表明该基因偏好使用G和C并以G或C结尾的密码子；而CaABR1的GC和GC3s值分别为0.497和0.378，可见其密码子整体上对碱基的选择趋于随机，但密码子结尾碱基对A或T具有较强的偏好性。同义密码子相对使用度（relative synonymous codon usage，RSCU）分析发现（表3），CaERF109和CaABR1使用偏好性较强的密码子数（RSCU≥2.0）分别为4和3，进一步说明了2个基因的密码子偏好性较弱，但这些密码子可能作为该基因的最优密码子群。此外，TTA、TTG和ATA并不参与CaERF109的编码过程，ATC、CGC和CGG在CaABR1中的RSCU值也为0。