《表4 圆臀大黾蝽线粒体蛋白编码基因的密码子》

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《圆臀大黾蝽线粒体基因组密码子偏好性与COI基因适应性进化研究》


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注:*为最优密码子。

根据各基因的ENC值排序,筛选出由COIII、ND1组成的高表达组和ND6、ATP8组成的低表达组。由表4可知,通过计算2个基因组的RSCU值,找出△RSCU大于0.08且在高表达组中RSCU值大于1的密码子,最终确定了UUG、AUU、GUU、UCU、CCU、ACU、GCU、UAU、CAU、AAU、GAU、UGU、CGU和GGU共14个最优密码子(*表示)。其中有13个最优密码子以U结尾,1个以G结尾,表明U结尾的密码子是圆臀大黾蝽线粒体蛋白编码基因优先偏好使用的密码子。