《表4 桔青霉线粒体基因组蛋白质编码基因密码子使用情况》

《表4 桔青霉线粒体基因组蛋白质编码基因密码子使用情况》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《湖南益阳黑茶中桔青霉线粒体全基因组序列测定及分析》


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桔青霉线粒体蛋白质编码基因的相对同义密码子使用频率(RSCU)如表4所示,当RSCU数值大于1时,表示密码子的使用偏好较高,小于1则反之。除去终止密码子(Stop codon),桔青霉线粒体蛋白编码区共包含4 727个密码子。密码子使用情况显示,其对A和U碱基具有显著的偏向性,其中使用次数在200次以上的4个密码子分别是UUA(Leu)、AUA(Ile)、UUU(Phe)和GGU(Gly),密码子使用次数依次为618、322、263和209,这4种密码子在青霉属微生物P.digitatum[27]的线粒体蛋白质编码基因中也同为高频密码子,使用次数分别为638、305、300、211[27]。而UGC、GGC、CUC、CGA、CGC、CGG、UCG、UGG 8种密码子在桔青霉线粒体蛋白质编码基因中的使用次数均为0,在相对同义密码子的使用上与P.digitatum[27]具有较高的相似性。