《表3 不同物种DREB基因密码子使用偏性相关参数》
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《独行菜抗逆相关转录因子LaDREB密码子偏性与进化分析》
不同物种间DREB基因密码子具有不同的使用选择偏性。如表3,27个物种DREB基因密码子使用偏性存在差异。不同单双子叶植物DREB基因的CAI值范围为0.14~0.261,差异较小,GC值与ENc却有较大差异。27个物种DREB基因的ENc平均值为49.571,均大于35,表明27个物种基因的密码子使用偏性和表达水平有一定差异,且选择使用偏性和表达水平都较低,这与CAI指数验证结果一致。高山离子芥的ENc值=61,表明其密码子使用选择上无偏性。双子叶植物中欧洲白桦、猕猴桃、毛果杨、草莓、胡杨、小叶杨、河北杨、杧果、茄、番木瓜等的DREB基因与独行菜La DREB基因的密码子使用偏性相关参数相似,ENc值的平均值为49.17,值的范围为37.46~61.00。表明双子叶植物DREB基因在翻译过程中,选择密码子编码氨基酸时偏性不强;但单子叶植物DREB基因的ENc值在53.56~55.50,平均值54.53,高于双子叶植物的ENc值,暗示这些植物DREB基因密码子使用偏性较双子叶弱,其表达量可能较双子叶植物更低。
图表编号 | XD00198821200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.20 |
作者 | 周茜、陈芸、卢函、王玉州、王继莲、赵惠新 |
绘制单位 | 喀什大学生命与地理科学学院、叶尔羌绿洲生态与生物资源研究高校重点实验室、喀什大学生命与地理科学学院、叶尔羌绿洲生态与生物资源研究高校重点实验室、和田师范专科学校生地学院、喀什大学生命与地理科学学院、叶尔羌绿洲生态与生物资源研究高校重点实验室、喀什大学生命与地理科学学院、叶尔羌绿洲生态与生物资源研究高校重点实验室、新疆师范大学生命科学学院、新疆特殊环境物种保护与调控生物学实验室、干旱区植物逆境生物学实验室 |
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