《表5 独行菜La DREB基因与模式生物基因组密码子使用偏性比较》
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《独行菜抗逆相关转录因子LaDREB密码子偏性与进化分析》
LaDREB、At、Nt、Sl、Os、Zm、Ec、Sc分别表示独行菜LaDREB基因及拟南芥、烟草、番茄、水稻、玉米、大肠杆菌、酵母菌基因组密码子使用频率;下划线表示具有明显偏差的分值(≤0.5,≥2.0)
独行菜的遗传转化体系仍未完善,独行菜基因还需其它完善的遗传转化受体来进行异源转化。将独行菜La DREB基因与大肠杆菌、酵母菌、拟南芥、烟草、番茄、水稻和玉米基因组中不同密码子选择使用的频率相比较。如表5,独行菜La DREB基因与大肠杆菌和酵母菌,分别有12和17个密码子偏性差异明显,说明大肠杆菌原核表达体系更适合独行菜La DREB基因的异源表达。分析比较独行菜La DREB基因与模式植物拟南芥、烟草和番茄密码子使用偏性,发现其与拟南芥、烟草和番茄的基因组选用频率差异较大个数分别为12、13和13;而水稻为12,玉米为20。表明拟南芥和水稻在独行菜La DREB基因遗传转化功能验证中,都是适用的异源受体。而拟南芥与独行菜同属十字花科,与独行菜亲缘关系较近,能作为独行菜瞬时表达的良好受体。
图表编号 | XD00198821700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.20 |
作者 | 周茜、陈芸、卢函、王玉州、王继莲、赵惠新 |
绘制单位 | 喀什大学生命与地理科学学院、叶尔羌绿洲生态与生物资源研究高校重点实验室、喀什大学生命与地理科学学院、叶尔羌绿洲生态与生物资源研究高校重点实验室、和田师范专科学校生地学院、喀什大学生命与地理科学学院、叶尔羌绿洲生态与生物资源研究高校重点实验室、喀什大学生命与地理科学学院、叶尔羌绿洲生态与生物资源研究高校重点实验室、新疆师范大学生命科学学院、新疆特殊环境物种保护与调控生物学实验室、干旱区植物逆境生物学实验室 |
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