《表3 苋菜CRY1与代表生物密码子使用偏性比较》
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《苋菜蓝光受体基因AmCRY1密码子使用模式及分析》
下划线表示AmCRY1与其他生物基因组密码子使用偏好差异较大.
本文利用苋菜AmCRY1基因与大肠杆菌(Escherichia coli,E)、酵母菌(Saccharonmyces cerevisine,S.c)、拟南芥(Arabidopsis thaliana,A)、烟草(Nicotiana tabacum,N)、番茄(Solanum lycopersicum,S.l)、苋菜(Amaranthus tricolor,Am)、甜菜(Beta vulgaris,B)基因组密码子使用频率的比值,筛选密码子使用差异较大的个数,发现苋菜AmCRY1基因与大肠杆菌、酵母菌的密码子使用频率差异性较大的个数分别为22、12.比较而言,酵母菌更适合做苋菜AmCRY1基因的真核表达受体.AmCRY1基因与拟南芥、烟草、番茄基因组密码子使用频率差异较大的个数分别为8、13、12,表明对于AmCRY1基因来说,拟南芥表达系统优于烟草和番茄.AmCRY1基因与苋菜本身的基因组密码子使用频率差异较大的个数为11.甜菜与苋菜亲源关系最近,在色素代谢途径上也极为相似,其密码子使用频率与苋菜AmCRY1基因的密码子使用频率的差异较大的个数为11,表明甜菜可以作为苋菜AmCRY1基因瞬时表达的受体(表3).
图表编号 | XD00142344500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.25 |
作者 | 王晓、赵春丽、彭丽云、赖钟雄、刘生财 |
绘制单位 | 福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所 |
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