《表2 不同物种间HY5与常见模式生物基因组密码子使用偏性比较》

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《香蕉MaHY5基因密码子的偏好性分析》

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注:下划线表示密码子使用频率差异较大

香蕉的遗传转化体系与模式植物相比仍然不成熟，转化效率低，体系仍需要不断完善（张俊芳等，2014）。在广泛的研究中，进行探究相关基因的功能特征的载体一般使用拟南芥、烟草等模式植物；而做基因真核表达、原核表达系统的受体一般使用酵母菌以及大肠杆菌。本研究通过将拟南芥、烟草、番茄等模式植物以及大肠杆菌、酵母菌的基因组密码子使用频率与香蕉Ma HY5基因进行比值，结果显示（表2），从中筛选出比值小于等于0.5以及比值大于等于2.0的密码子，说明两者该密码子使用差异较大。结果发现香蕉Ma HY5基因与大肠杆菌密码子使用偏性差异较大的个数为16个，而与酵母菌的密码子使用偏性差异较大的个数分别为20个，相对而言，大肠杆菌更适合做香蕉Ma HY5基因的原核表达载体，然而二者密码子使用偏性仍有较大差异，实验时仍需要进行改造以及优化。同样发现，香蕉Ma HY5基因与拟南芥基因组密码子使用偏性差异较大的个数为18，而与烟草和番茄基因组密码子使用偏性差异较大的个数均为20，因此拟南芥是香蕉Ma HY5基因进行遗传转化较为理想的受体。