《表3 DREB2A基因的密码子偏好性参数》

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《不同水稻种质中渗透胁迫抗性基因DREB2A的遗传多样性分析》

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通过统计各组DREB2A等位基因的RSCU平均值，发现各组对于密码子GAC的使用度均为0。Group I和Group II的密码子偏好性基本一致，而与Group III之间存在较大的差异，例如，Group I和Group II的相对同义密码子使用度最高的都是CCU，平均RSCU值都为2.25，Group III中密码子CCU的使用度为1.71，Group III的相对同义密码子使用度最高的是AGG（T），RSCU的平均值为2.12，密码子UCG和终止密码子UAA是Group III所特有的，其使用度为0.14和0.19，Group I和Group II中密码子UUA和AUU的使用度为1.29和0.33，而在Group III中为1.12和0.83。在编码同种氨基酸时，Group III和另外2组所使用的密码子数量存在差异，例如，在编码亮氨酸（L）时，Group I和Group II使用了5种同义密码子，而Group III使用了6种同义密码子。同时，各组编码同种氨基酸的同义密码子的所占比例也有所不同，例如，在编码异亮氨酸（I）时，Group I和Group II中密码子AUU、AUC和AUA的比例为0.33:1.67:1，在Group III中的比例为0.83:1.25:0.93。密码子偏好性聚类在一定程度上可以反映物种进化的关系，对12个DREB2A等位基因的RSCU值进行聚类分析发现，非洲栽培稻（Oryza glaberrima）的3个等位基因分为了一组，说明非洲栽培稻（Oryza glaberrima）中的DREB2A基因在密码子使用法则上与其他类型的同源基因具有很大的差异。这些结果表明，非洲栽培稻（Oryza glaberrima）和普通栽培稻（Oryza sativa）中的DREB2A同源基因的密码子偏好性具有明显差异，暗示了2个栽培稻中的DREB2A基因具有各自独立的系统进化途径。