《表1 全长转录组数据统计》

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《薏苡苗期叶片全长转录组测序、注释及SSR预测》

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利用SMRT测序技术平台PacBio Sequel TM对干旱胁迫下薏苡叶片混合样品cDNA文库测序，获得442 683条RoIs（Reads of Insert）序列，共计14.06 Gb clean data数据，其中全长非嵌合（full-length-nonchimeric，FLNC）的RoI序列408 107条，占92.19%。经CD-HIT软件将FLNC序列聚类，共获得长度为200 bp的非冗余、高质量全长转录本98 858条Isoforms即Unigenes（表1）。其中，Unigenes序列总长度为229 204 845 bp，平均长度为2 318 bp，N50和N90长度分别为2 558 bp和1 540 bp，GC含量为50.55%（表1）。进一步对Unigenes长度分布进行统计分析，发现：1 kb的Unigenes数量为90 732（占91.74%），集中分布在1～2 kb、2～3 kb和3～4 kb范围，占比分别为33.86%、36.76%和14.59%（图1A）。