《表1 玉米下机转录组数据统计》

《表1 玉米下机转录组数据统计》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于RNA-seq技术的玉米SNP和InDel标记分析》


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注:Q30:碱基识别准确率在99.9%以上的碱基总数;N rate:模糊碱基所占百分比;Q20 rate:碱基识别准确率在99.0%以上的碱基所占百分比;Q30 rate:碱基识别准确率在99.9%以上的碱基所占百分比

经过建库的所有实验操作后,最后得到下机数据(表1)。Reads总数最少为40 419 240个(T1),最高为53 256 516个(CK3),平均为47 125 405个;碱基总数最低为6 062 886 000个(T1),碱基总数最高为7 988 477 400个(CK3),平均为7 068 810 750个,即平均超为7 Gb的数据量。此外,从模糊碱基占碱基总数比例、碱基识别准确率超过99%和99.9%的碱基所占比例来看,均达到了转录组测序结果的基本要求。