《表2 EgAQPs基因密码子选用偏好性参数》

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《细粒棘球绦虫水通道蛋白基因家族成员密码子偏好性分析》

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注:T3s，C3s，A3s，G3s，GC3s分别表示密码子的第3位是T，C，A，G，G+C的含量

有效密码子数（effective number of codons，ENC）的参考范围为20～61，越靠近20偏好性越强。CodonW软件分析可以发现EgAQPs基因的ENc值为57.66，说明EgAQPs基因各密码子使用偏离随机选择的程度比较一致（表2）。密码子适应指数（codon adaptation index，CAI）值在0～1之间，值越接近1，基因的密码子偏好性越强，EgAQPs基因CAI平均值为0.22。密码子偏好指数（codon bias index，CBI）往往用来阐释某一特定的基因中所有最优密码子的组分情况，EgAQPs基因CBI平均为0.08，以上结果均说明E-gAQPs基因具有较弱的密码子偏好性。EgAQPs基因G3s平均含量为26.44%，C3s平均含量为37.66%，均高于A3s及T3s的含量。GC含量的平均值为50.33%，GC3s含量的平均值为53.26%，两值均大于50%，这表明EgAQPs基因的CDS编码区碱基选择及其密码子第三位的碱基选择上均存在较弱的C/G的偏好性，偏好使用以C/G结尾的密码子。