《表4 苹果WOX家族基因密码子偏好性分析结果》

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《苹果WUSCHEL-related homeobox(WOX)家族基因的鉴定与分析》


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密码子适应指数(CAI)、密码子偏爱指数(CBI)、最优密码子使用频率(Fop)、有效密码子数(ENC)、氨基酸组分指数(GC)等如表4显示,苹果WOX家族外显子的GC含量范围为44.3%~50.6%,平均GC含量为47.35%,GC3s含量范围为38%~56%,平均GC3s含量为46.33%,平均Fop为0.4348,平均CAI为0.2221,平均CBI为0.0059。基因的ENC值反映了整个基因的密码子偏好性,其范围是20~61。ENC越接近20表明其密码子偏好性越强,越接近60表明其密码子偏好性越弱(Gupta et al.,2004)。苹果WOX家族的ENC的范围为49.08~57.49,均值大于50,说明密码子偏好性较弱。