《表4 苹果WOX家族基因密码子偏好性分析结果》
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《苹果WUSCHEL-related homeobox(WOX)家族基因的鉴定与分析》
密码子适应指数(CAI)、密码子偏爱指数(CBI)、最优密码子使用频率(Fop)、有效密码子数(ENC)、氨基酸组分指数(GC)等如表4显示,苹果WOX家族外显子的GC含量范围为44.3%~50.6%,平均GC含量为47.35%,GC3s含量范围为38%~56%,平均GC3s含量为46.33%,平均Fop为0.4348,平均CAI为0.2221,平均CBI为0.0059。基因的ENC值反映了整个基因的密码子偏好性,其范围是20~61。ENC越接近20表明其密码子偏好性越强,越接近60表明其密码子偏好性越弱(Gupta et al.,2004)。苹果WOX家族的ENC的范围为49.08~57.49,均值大于50,说明密码子偏好性较弱。
图表编号 | XD0081717900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.06.25 |
作者 | 王楚堃、韩朋良、王咏梅、王鹏飞、胡大刚 |
绘制单位 | 山东农业大学园艺科学与工程学院作物生物学国家重点实验室农业部黄淮地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、山东农业大学园艺科学与工程学院作物生物学国家重点实验室农业部黄淮地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、山东省葡萄研究院、山东省葡萄研究院、山东农业大学园艺科学与工程学院作物生物学国家重点实验室农业部黄淮地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室 |
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