《表2 香蕉AQP基因家族4个亚家族密码子使用参数分析结果》

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《香蕉水通道蛋白基因家族的密码子偏好性分析》

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从香蕉基因组筛选获得54条AQP基因，其中NIPs、PIPs、SIPs和TIPs分别有9、21、4和20条。通过Condon W和Embossexplorer分析发现，香蕉AQP家族基因总G+C（GC）含量在43.3%~68.4%（Ma SIP2-1最低，仅为43.3%），平均GC含量为60.5%；第3位碱基G+C（GC3s）含量在41.1%~93.8%，平均GC3s含量为75.8%；密码子第3位碱基上A、T、C、G平均出现频率分别为12.0%、15.9%、52.3%和37.4%，说明香蕉AQP家族基因偏好使用含有G/C的密码子，而且对以G/C结尾的密码子偏性较强（表1）。通过比较AQP 4个亚家族的密码子组成发现，NIPs、PIPs和TIPs3个亚家族对G/C结尾和G/C含量高的密码子的偏好性略高于SIPs（表2）。