《表3 苹果和拟南芥WOX蛋白的最保守基序序列》

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《苹果WUSCHEL-related homeobox(WOX)家族基因的鉴定与分析》

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利用MEME软件分析拟南芥和苹果WOX家族基因编码蛋白的保守基序，鉴定出20个保守基序（表3）。结果（图2）发现，16个拟南芥和12个苹果WOX蛋白序列均含有motif-1，进一步对该基序进行分析，发现motif-1结构域包含WOX家族homeobox的结构域序列；除了拟南芥At WOX15以外，所有蛋白序列均含有motif-2。对WOX家族各进化分支进行分析发现，拟南芥和苹果WOX家族的基序具有家族分支特异性，除AtWOX10和AtWOX14外，祖先进化支均含有motif-3、motif-7和motif-8。除拟南芥AtWOX7外，现代进化支的都含有motif-5。除拟南芥AtWOX15外，中间进化支都含有motif-4和motif-14，进一步支持了系统发育树中苹果WOX家族编码蛋白的分组结果。