《表1 豆科植物蛋白保守基序》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《豆科全基因组DGAT基因家族的鉴定与进化分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

基序是基因DNA和氨基酸序列中的保守序列，是二级结构和三级结构之间的一种结构形式。为对豆科DGAT基因的保守结构进行比较，对家族基因的基序进行了预测，并对其进行了展示（图2）。结果显示，外类群葡萄和豆科14个基因组（其中四倍体花生栽培中包含2个亚基因组）中DGAT基因的基序组成具有多种形式。保守基序分析结果显示，92个DGAT家族基因中包含1至15个基序，每个基序的长度在15～50个氨基酸之间。氨基酸长度最长的是motif4、5、6、8、10、12、13，均含有50个氨基酸；氨基酸长度较短的是motif16、18、19，仅含有15个氨基酸（表1）。从92个DGAT家族基因的保守基序结构中发现，豆科特征序列的基本结构大致可以分为两类，一类基本含有motif 19、7、5、13、6、18、11、8、20、2、1、10、9、15，如Ad06g2283；另一类则基本包含motif 17、12、3、16、2、1、14、4，如Ad01g0891。这可能是由于DGAT在植物中功能上的差异。其中Aha01g0810、Aha06g0857、Ahb06g1904、Ahb06g1903、Ai06g1751、Ai06g1750、Vu11g01380只含有1到4个基序。通过Pfam在线软件搜索20种基序的结构域发现，motif1、motif3、motif4和motif12中包含有DGAT结构域，所以鉴定所得的DGAT基因至少包含其中的一个基序。