《表4 27种不同植物GA20ox蛋白的保守基序的序列结构及命名》

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《植物赤霉素氧化酶GA20ox基因的生物信息学分析》

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利用MEME在线软件预测27个不同植物GA20ox蛋白的保守基序（图2），并利用SMART在线软件对其预测的保守基序进行分析（表4）。供试27个不同植物GA20ox蛋白中都存在基序1～5中（图2），由此可知，这些基序是GA20ox的保守基序。其中，基序1含有41个氨基酸，最佳匹配序列为FFEENDSIMRLNYYPPCQKPDLTLGTGPHCDPSLT-ILHQD；基序2含有48个氨基酸，最佳匹配序列为WRSISPNPNAFWNIGDTFMALSNGRYKSCL HRA-WNSKTPPKSLAFFLC；SMART在线软件分析表明这两个基序为2OG-FeII＿Oxy域，同时，还串联一个基序3，含有50个氨基酸，最佳匹配序列为AHRYM-DTFFDMPLSEKQKAQRKIGEHCGYASSFTGRFSS-KLPWKETLSFR，该基序为DIOX＿N域，它是具有2-氧戊二酸/Fe（Ⅱ）依赖性双加氧酶活性的蛋白质的高度保守的N-末端区域[（PUBMED:20228795）]。另外，27个不同植物GA20ox蛋白均还存在2个未知功能的基序4和基序5，最佳匹配序列分别为ELVDSNNPRIYPDFTWPTLLEFTQKHYRADMNTL-QTFSNWL和SEFGRVYQEYCEAMSTLSLGIMEL-LGMSLGVSREHFR，它们都属于SCOP域。可见，植物GA20ox蛋白具有高度保守的共同基序，这可能与其特定功能作用有关。