《表2 莲ARF基因家族保守基序的分布情况》
为了更进一步分析ARF基因家族在莲中的分布情况,预测其保守基序,LARF基因家族中预测含有15个保守基序,每条蛋白序列上所包含的保守基序的类型和数目存在一定差异,这些保守基序类型和数目上的差异揭示了其功能的多样性。除了LARF26、LARF27、LARF28、LARF29、LARF30不含motif1外,其余均含有motif1。motif2不含LARF26、LARF27、LARF28、LARF29。相比于motif1与motif2,除了LARF20、LARF26、LARF27、LARF28、LARF29、LARF30外,其余均含有motif3。相比于前三者,motif4出现了15次,motif5出现26次,motif6出现27次,motif7出现25次,motif8出现27次,motif9出现20次,motif10出现22次,motif11出现25次,motif12出现28次,motif13出现22次,motif14出现16次,motif15出现16次,如表2、图3所示。结果表明,在图中蛋白质序列中出现次数较高的motif为有着重要功能的保守基序,十分重要。其中motif1、motif2、motif3等分布较为广泛参与到多种非生物和生物胁迫的调节过程等。虽然很多基序的功能暂未可知,但它们与莲的细胞的分裂分化和伸长、根茎的形态建成、维管组织的形成和分化、器官衰老、顶端优势、向性运动及应对外界压力等生长发育方面密切相关。
图表编号 | XD00167184800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.15 |
作者 | 苏静、王柯阳、董臣、周江波、李兰芝 |
绘制单位 | 湖南农业大学湖南省农业大数据分析与决策工程技术研究中心、湖南农业大学湖南省农业大数据分析与决策工程技术研究中心、河南工业大学生物工程学院、贵州省凯里学院大健康学院、湖南农业大学湖南省农业大数据分析与决策工程技术研究中心 |
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