《表2 朝仓花椒ARF基因家族基本性质》
对朝仓花椒幼芽的转录组数据进行分析,将测序得到的基因片段与NCBI数据库进行比对,注释信息结合ARF蛋白保守结构域的预测,最终鉴定得到23条朝仓花椒的ARF家族基因(表2)。通过ExPASy在线工具,对朝仓花椒ARF基因家族进行理化性质分析。分析结果显示,23条ZpARF基因编码长度范围为690 bp(ZpARF18)~3 315 bp(ZpARF8),编码氨基酸长度范围为229 aa(ZpARF18)~1 104aa(ZpARF8),蛋白分子量为24.65 kDa(ZpARF18)~121.74 kDa(ZpARF8),其等电点范围为5.04(ZpARF5)~9.64(ZpARF7),有3个蛋白等电点大于7,偏碱性,其余20个蛋白等电点均小于7,偏酸性。ZpARF蛋白不稳定系数均大于40,为不稳定蛋白。
图表编号 | XD00181518900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.07.20 |
作者 | 刘伟、赵懿琛、廖震、赵德刚 |
绘制单位 | 贵州大学药学院、贵州大学生命科学学院、农业生物工程研究院、山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室、贵州大学茶学院、贵州大学生命科学学院、农业生物工程研究院、山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室、贵州大学生命科学学院、农业生物工程研究院、山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室、贵州大学生命科学学院、农业生物工程研究院、山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室、贵州省农业科学院、国家农业部植物新品种DUS测试贵阳分中心 |
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