《表2 杜仲LOX基因家族蛋白理化性质分析》

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《杜仲脂氧合酶基因家族全基因组鉴定及其表达特性研究》


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利用Protparam在线工具分析杜仲LOX蛋白一级结构,表2显示杜仲23个LOX基因家族成员中,EUC22336-RA编码的氨基酸数量最多为968aa,EUC24023-RA编码的氨基酸数量最少为92,同时结果表明杜仲LOX基因家族编码氨基酸数目与其分子质量整体呈正相关,23个LOX基因的氨基酸数量和分子质量均具有差异。根据理论等电点氨基酸可以分为碱性氨基酸(Theoretical pI>7)和酸性氨基酸或中性氨基酸(Theoretical p I≦7);蛋白质总平均疏水性正值表现疏水性、负值表现为亲水性,且疏水值越大越疏水,值越小越亲水。其中EUC05484-RA为9-LOX家族成员,编码氨基酸数量为401,理论等电点是5.98,为酸性氨基酸,同时总平均疏水值为-0.312,为亲水性氨基酸。其余13-LOX类型中包括6个碱性氨基酸和16个酸性氨基酸或中性氨基酸,22个LOX蛋白疏水值均为负值,表现为亲水性。